응용화학생명공학과는 응용화학 및 생명공학 산업에 필요한 최첨단 융합 전공지식을 함유한 인재 양성을 목적으로 2008년 응용화학 전공과 생명공학 전공이 통합되었다. 전공의 통합에 의해 아주대학교가 지향하는 실사구시에 입각한 융합교육, 융합연구 중심 학부로서 관련 산업체, 연구소 및 학계를 이끌어 나갈 글로벌 리더 양성에 강점을 갖고 있다.
또한 최근의 화학, 생명 산업계의 요구와 교육환경에 전문 고급지식을 함유한 인재 양성을 위해서 응용화학 및 생명공학 전공 각각의 특징과 강점을 그대로 유지하고, 나노메디컬, 화장품공학, 생체 공학, 대체에너지 등 융복합학문 분야 내용의 고급 심화 전공 등의 구성으로 전문심화지식 습득 및 배양을 위한 교과목 내용으로 교육이 구성되어져 있는 강점이 있다.
연구 분야에서는 학과교수의 주도하에 BK21 사업을 1단계에 이어 2단계에도 "과학기술분야 응용분야"에서 대형사업단 규모로 선정, 유치하였고, BK21 2007년도, 2011년도 사업단 연차평가에서 "과학기술분야 응용분야 (제3분야) 대형사업단 중 종합1위를 차지하는 우수 저력을 가지고 있다.